เรื่องราวของ “เจจุงวอน ตำนานแพทย์แห่งโชซอน” ถ่ายทอดเหตุการณ์ในช่วงเปลี่ยนผ่านยุคสมัยของโชซอน เมื่อวิทยาการแพทย์สมัยใหม่เริ่มเข้ามามีบทบาท ซีรีย์นี้เล่าถึงจุดเริ่มต้นของ “เจจุงวอน” โรงพยาบาลสมัยใหม่แห่งแรกในเกาหลีใต้ ที่เปิดรับการรักษาทั้งคนธรรมดาและชนชั้นสูงอย่างเท่าเทียม สะท้อนถึงการเปลี่ยนแปลงทางสังคมและวัฒนธรรมที่ขัดแย้งกันในยุคนั้น
ตัวละครหลักประกอบไปด้วยแพทย์ฝึกหัดที่มาจากชนชั้นต่าง ๆ ที่ต้องเผชิญกับความยากลำบากเพื่อรักษาคนไข้ด้วยวิทยาศาสตร์การแพทย์ใหม่ แม้จะมีแรงกดดันจากความเชื่อดั้งเดิมและการต่อต้านจากชนชั้นสูงในสังคม พวกเขายังคงมุ่งมั่นในการเปลี่ยนแปลงเพื่อชีวิตที่ดีกว่า
ซีรีย์ยังสอดแทรกเรื่องราวของมิตรภาพ ความรัก และการเสียสละของตัวละครที่ต้องเผชิญกับสถานการณ์ที่เต็มไปด้วยความขัดแย้งและความหวัง รวมถึงการเรียนรู้ที่จะรวมเอาวัฒนธรรมดั้งเดิมและความก้าวหน้าสมัยใหม่เข้าด้วยกัน